Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LTBP4Q8N2S1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
LTBP4Q8N2S1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
LTBP4Q8N2S1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
LTBP4Q8N2S1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
LTBP4Q8N2S1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
LTBP4Q8N2S1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
LTBP4Q8N2S1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LTBP4Q8N2S1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LTBP4Q8N2S1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
LTBP4Q8N2S1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
LTBP4Q8N2S1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LTBP4Q8N2S1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LTBP4Q8N2S1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LTBP4Q8N2S1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LTBP4Q8N2S1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LTBP4Q8N2S1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
LTBP4Q8N2S1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
LTBP4Q8N2S1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
LTBP4Q8N2S1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
LTBP4Q8N2S1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
LTBP4Q8N2S1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
LTBP4Q8N2S1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
LTBP4Q8N2S1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
LTBP4Q8N2S1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
LTBP4Q8N2S1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
LTBP4Q8N2S1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
LTBP4Q8N2S1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
LTBP4Q8N2S1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
LTBP4Q8N2S1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
LTBP4Q8N2S1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
LTBP4Q8N2S1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
LTBP4Q8N2S1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
LTBP4Q8N2S1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LTBP4Q8N2S1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms