Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLGN4XQ8N0W4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN4XQ8N0W4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLGN4XQ8N0W4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms