Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LINC00518Q8N0U6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00518Q8N0U6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00518Q8N0U6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00518Q8N0U6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00518Q8N0U6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00518Q8N0U6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms