Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNGA4Q8IV77 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNGA4Q8IV77 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNGA4Q8IV77 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNGA4Q8IV77 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNGA4Q8IV77 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms