Protein–RNA interactions for Protein: Q86VY9

TMEM200A, Transmembrane protein 200A, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200AQ86VY9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM200AQ86VY9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM200AQ86VY9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM200AQ86VY9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM200AQ86VY9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM200AQ86VY9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms