Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF554Q86TJ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF554Q86TJ5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF554Q86TJ5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF554Q86TJ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms