Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CACNA2D4Q7Z3S7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CACNA2D4Q7Z3S7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CACNA2D4Q7Z3S7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACNA2D4Q7Z3S7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms