Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC11Q7Z392 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRAPPC11Q7Z392 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC11Q7Z392 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC11Q7Z392 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC11Q7Z392 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms