Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 GBA-201ENST00000327247 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.32e-8■■■■■ 31.6
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SND1Q7KZF4 GBA-202ENST00000368373 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.472e-8■■■■■ 31.6
SND1Q7KZF4 GBA-203ENST00000427500 2063 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 31.6
SND1Q7KZF4 GBA-212ENST00000491081 892 ntTSL 210.17□□□□□ -0.782e-8■■■■■ 31.6
SND1Q7KZF4 GBA-211ENST00000484489 749 ntTSL 59.76□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 31.6
SND1Q7KZF4 GBA-205ENST00000460156 750 ntTSL 27.88□□□□□ -1.152e-8■■■■■ 31.6
SND1Q7KZF4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.353e-7■■■■■ 31.6
SND1Q7KZF4 CPVL-201ENST00000265394 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 31.6
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SND1Q7KZF4 CD81-215ENST00000530648 558 ntTSL 414.51□□□□□ -0.098e-11■■■■■ 31.5
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SND1Q7KZF4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.782e-12■■■■■ 31.5
SND1Q7KZF4 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.762e-12■■■■■ 31.5
SND1Q7KZF4 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.032e-12■■■■■ 31.5
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SND1Q7KZF4 STC2-202ENST00000518455 473 ntTSL 510.4□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 31.4
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SND1Q7KZF4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.597e-14■■■■■ 31.4
SND1Q7KZF4 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.197e-14■■■■■ 31.4
SND1Q7KZF4 RDH11-206ENST00000554035 849 ntTSL 39.4□□□□□ -0.97e-8■■■■■ 31.4
SND1Q7KZF4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.574e-8■■■■■ 31.4
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SND1Q7KZF4 ERP29-201ENST00000261735 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.49e-10■■■■■ 31.4
SND1Q7KZF4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.512e-8■■■■■ 31.3
SND1Q7KZF4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.842e-8■■■■■ 31.3
SND1Q7KZF4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.672e-8■■■■■ 31.3
SND1Q7KZF4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 31.3
SND1Q7KZF4 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 31.3
SND1Q7KZF4 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.242e-8■■■■■ 31.3
SND1Q7KZF4 MAGED2-204ENST00000375058 2048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 31.3
SND1Q7KZF4 MAGED2-202ENST00000347546 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.382e-8■■■■■ 31.3
SND1Q7KZF4 CPVL-204ENST00000432534 679 ntTSL 311.65□□□□□ -0.542e-12■■■■■ 31.3
SND1Q7KZF4 SERPINH1-214ENST00000533449 582 ntTSL 318■□□□□ 0.471e-19■■■■■ 31.3
SND1Q7KZF4 PDIA4-203ENST00000466592 632 ntTSL 215.52■□□□□ 0.081e-19■■■■■ 31.3
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SND1Q7KZF4 SLC39A1-207ENST00000429040 1141 ntTSL 217.65■□□□□ 0.425e-9■■■■■ 31.3
SND1Q7KZF4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.415e-9■■■■■ 31.3
SND1Q7KZF4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.395e-9■■■■■ 31.3
SND1Q7KZF4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.345e-9■■■■■ 31.3
SND1Q7KZF4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.265e-9■■■■■ 31.3
SND1Q7KZF4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.524e-15■■■■■ 31.3
SND1Q7KZF4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.466e-13■■■■■ 31.3
SND1Q7KZF4 AL591806.3-202ENST00000470694 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 219.97■□□□□ 0.791e-10■■■■■ 31.2
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SND1Q7KZF4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.681e-15■■■■■ 31.2
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SND1Q7KZF4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.391e-15■■■■■ 31.2
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SND1Q7KZF4 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.321e-15■■■■■ 31.2
SND1Q7KZF4 CPVL-206ENST00000447426 553 ntTSL 56.9□□□□□ -1.37e-8■■■■■ 31.2
SND1Q7KZF4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 31.1
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SND1Q7KZF4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 31.1
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SND1Q7KZF4 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.055e-9■■■■■ 31.1
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SND1Q7KZF4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.692e-8■■■■■ 31.1
SND1Q7KZF4 RUNX1-208ENST00000455571 610 ntTSL 318.95■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 31.1
SND1Q7KZF4 HSD17B12-211ENST00000636007 563 ntTSL 418.73■□□□□ 0.592e-8■■■■■ 31.1
SND1Q7KZF4 HSD17B12-206ENST00000531185 611 ntTSL 417.18■□□□□ 0.342e-8■■■■■ 31.1
SND1Q7KZF4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.02■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 31.1
SND1Q7KZF4 HSD17B12-205ENST00000527433 559 ntTSL 414.9□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 31.1
SND1Q7KZF4 CYB561A3-206ENST00000536452 1827 ntTSL 214.01□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 31.1
SND1Q7KZF4 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.182e-8■■■■■ 31.1
SND1Q7KZF4 HSPA4-201ENST00000304858 4825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.272e-8■■■■■ 31.1
SND1Q7KZF4 RUNX1-214ENST00000475045 1582 ntTSL 511.79□□□□□ -0.522e-8■■■■■ 31.1
SND1Q7KZF4 HSD17B12-204ENST00000527213 571 ntTSL 410.12□□□□□ -0.792e-8■■■■■ 31.1
SND1Q7KZF4 AC068205.2-203ENST00000529261 748 ntTSL 310.08□□□□□ -0.82e-8■■■■■ 31.1
SND1Q7KZF4 RUNX1-206ENST00000416754 346 ntTSL 1 (best)9.13□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 31.1
SND1Q7KZF4 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.052e-8■■■■■ 31.1
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SND1Q7KZF4 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.72□□□□□ -2.292e-8■■■■■ 31.1
SND1Q7KZF4 GLA-207ENST00000493905 1358 ntTSL 511.51□□□□□ -0.572e-9■■■■■ 31.1
SND1Q7KZF4 GLA-201ENST00000218516 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.742e-9■■■■■ 31.1
SND1Q7KZF4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.872e-8■■■■■ 31.1
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SND1Q7KZF4 AC114490.2-201ENST00000487874 3099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 31.1
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