Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSZ5

ARHGEF18, Rho guanine nucleotide exchange factor 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF18Q6ZSZ5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARHGEF18Q6ZSZ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF18Q6ZSZ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF18Q6ZSZ5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF18Q6ZSZ5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF18Q6ZSZ5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms