Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF111Q6ZNA4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF111Q6ZNA4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF111Q6ZNA4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF111Q6ZNA4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms