Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDZRN4Q6ZMN7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZRN4Q6ZMN7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDZRN4Q6ZMN7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDZRN4Q6ZMN7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.3 ms