Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEACAM20Q6UY09 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEACAM20Q6UY09 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CEACAM20Q6UY09 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms