Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD1Q6UWL2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUSD1Q6UWL2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SUSD1Q6UWL2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SUSD1Q6UWL2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms