Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI98

INO80C, INO80 complex subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80CQ6PI98 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
INO80CQ6PI98 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INO80CQ6PI98 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
INO80CQ6PI98 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
INO80CQ6PI98 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
INO80CQ6PI98 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INO80CQ6PI98 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
INO80CQ6PI98 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
INO80CQ6PI98 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
INO80CQ6PI98 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
INO80CQ6PI98 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
INO80CQ6PI98 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80CQ6PI98 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80CQ6PI98 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
INO80CQ6PI98 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INO80CQ6PI98 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INO80CQ6PI98 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
INO80CQ6PI98 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
INO80CQ6PI98 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80CQ6PI98 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
INO80CQ6PI98 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms