Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1L6

ZNF343, Zinc finger protein 343, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF343Q6P1L6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF343Q6P1L6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF343Q6P1L6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF343Q6P1L6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF343Q6P1L6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF343Q6P1L6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF343Q6P1L6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF343Q6P1L6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF343Q6P1L6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF343Q6P1L6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF343Q6P1L6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF343Q6P1L6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF343Q6P1L6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF343Q6P1L6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF343Q6P1L6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF343Q6P1L6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF343Q6P1L6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF343Q6P1L6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF343Q6P1L6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF343Q6P1L6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF343Q6P1L6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF343Q6P1L6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF343Q6P1L6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF343Q6P1L6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF343Q6P1L6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF343Q6P1L6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF343Q6P1L6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF343Q6P1L6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms