Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GDF6Q6KF10 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF6Q6KF10 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GDF6Q6KF10 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GDF6Q6KF10 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GDF6Q6KF10 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms