Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB12Q6IQ22 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB12Q6IQ22 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB12Q6IQ22 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB12Q6IQ22 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms