Protein–RNA interactions for Protein: Q66K66

TMEM198, Transmembrane protein 198, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM198Q66K66 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM198Q66K66 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM198Q66K66 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM198Q66K66 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM198Q66K66 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms