Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RSBN1Q5VWQ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RSBN1Q5VWQ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RSBN1Q5VWQ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RSBN1Q5VWQ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RSBN1Q5VWQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSBN1Q5VWQ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSBN1Q5VWQ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSBN1Q5VWQ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSBN1Q5VWQ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSBN1Q5VWQ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSBN1Q5VWQ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSBN1Q5VWQ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSBN1Q5VWQ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSBN1Q5VWQ0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSBN1Q5VWQ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RSBN1Q5VWQ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RSBN1Q5VWQ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RSBN1Q5VWQ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RSBN1Q5VWQ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RSBN1Q5VWQ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RSBN1Q5VWQ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RSBN1Q5VWQ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RSBN1Q5VWQ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms