Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SFMBT2Q5VUG0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFMBT2Q5VUG0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFMBT2Q5VUG0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SFMBT2Q5VUG0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFMBT2Q5VUG0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms