Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM164Q5U3C3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM164Q5U3C3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM164Q5U3C3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM164Q5U3C3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms