Protein–RNA interactions for Protein: Q5TBE3

C9orf153, Uncharacterized protein C9orf153, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf153Q5TBE3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf153Q5TBE3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf153Q5TBE3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf153Q5TBE3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1265.5 ms