Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFAP58Q5T655 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFAP58Q5T655 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CFAP58Q5T655 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP58Q5T655 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CFAP58Q5T655 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFAP58Q5T655 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP58Q5T655 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP58Q5T655 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP58Q5T655 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP58Q5T655 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP58Q5T655 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP58Q5T655 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP58Q5T655 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP58Q5T655 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP58Q5T655 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP58Q5T655 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms