Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
NHSL1Q5SYE7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NHSL1Q5SYE7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NHSL1Q5SYE7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NHSL1Q5SYE7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NHSL1Q5SYE7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms