Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
CEP170Q5SW79 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
CEP170Q5SW79 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CEP170Q5SW79 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
CEP170Q5SW79 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
CEP170Q5SW79 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
CEP170Q5SW79 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CEP170Q5SW79 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CEP170Q5SW79 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CEP170Q5SW79 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
CEP170Q5SW79 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
CEP170Q5SW79 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CEP170Q5SW79 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CEP170Q5SW79 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CEP170Q5SW79 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
CEP170Q5SW79 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
CEP170Q5SW79 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
CEP170Q5SW79 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC41.58■■■■■ 4.25
CEP170Q5SW79 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CEP170Q5SW79 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
CEP170Q5SW79 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CEP170Q5SW79 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CEP170Q5SW79 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CEP170Q5SW79 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CEP170Q5SW79 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
CEP170Q5SW79 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CEP170Q5SW79 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CEP170Q5SW79 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CEP170Q5SW79 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CEP170Q5SW79 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
CEP170Q5SW79 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
CEP170Q5SW79 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CEP170Q5SW79 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CEP170Q5SW79 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CEP170Q5SW79 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CEP170Q5SW79 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CEP170Q5SW79 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CEP170Q5SW79 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CEP170Q5SW79 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CEP170Q5SW79 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CEP170Q5SW79 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CEP170Q5SW79 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
CEP170Q5SW79 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CEP170Q5SW79 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CEP170Q5SW79 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CEP170Q5SW79 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CEP170Q5SW79 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
CEP170Q5SW79 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CEP170Q5SW79 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
CEP170Q5SW79 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CEP170Q5SW79 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
CEP170Q5SW79 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CEP170Q5SW79 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
CEP170Q5SW79 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CEP170Q5SW79 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
CEP170Q5SW79 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CEP170Q5SW79 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CEP170Q5SW79 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
CEP170Q5SW79 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
CEP170Q5SW79 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
CEP170Q5SW79 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms