Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HABP4Q5JVS0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HABP4Q5JVS0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HABP4Q5JVS0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HABP4Q5JVS0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
HABP4Q5JVS0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HABP4Q5JVS0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HABP4Q5JVS0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HABP4Q5JVS0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HABP4Q5JVS0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HABP4Q5JVS0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HABP4Q5JVS0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HABP4Q5JVS0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HABP4Q5JVS0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HABP4Q5JVS0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
HABP4Q5JVS0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HABP4Q5JVS0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HABP4Q5JVS0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HABP4Q5JVS0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HABP4Q5JVS0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HABP4Q5JVS0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms