Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP78Q5JTW2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CEP78Q5JTW2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CEP78Q5JTW2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CEP78Q5JTW2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms