Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ANKRD39Q53RE8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD39Q53RE8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD39Q53RE8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms