Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL22Q53GT1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL22Q53GT1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL22Q53GT1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms