Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACSM3Q53FZ2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACSM3Q53FZ2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACSM3Q53FZ2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSM3Q53FZ2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSM3Q53FZ2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSM3Q53FZ2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACSM3Q53FZ2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSM3Q53FZ2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSM3Q53FZ2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSM3Q53FZ2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSM3Q53FZ2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACSM3Q53FZ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSM3Q53FZ2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACSM3Q53FZ2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSM3Q53FZ2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSM3Q53FZ2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACSM3Q53FZ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms