Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXF1

FAM74A3, Putative protein FAM74A3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A3Q4VXF1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM74A3Q4VXF1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM74A3Q4VXF1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM74A3Q4VXF1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM74A3Q4VXF1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM74A3Q4VXF1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM74A3Q4VXF1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FAM74A3Q4VXF1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM74A3Q4VXF1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM74A3Q4VXF1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM74A3Q4VXF1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms