Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYTL3Q4VX76 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYTL3Q4VX76 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYTL3Q4VX76 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SYTL3Q4VX76 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL3Q4VX76 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYTL3Q4VX76 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.3 ms