Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TPRNQ4KMQ1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TPRNQ4KMQ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TPRNQ4KMQ1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TPRNQ4KMQ1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TPRNQ4KMQ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
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