Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CFAP100Q494V2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CFAP100Q494V2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CFAP100Q494V2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CFAP100Q494V2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CFAP100Q494V2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CFAP100Q494V2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CFAP100Q494V2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CFAP100Q494V2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CFAP100Q494V2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CFAP100Q494V2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CFAP100Q494V2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CFAP100Q494V2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CFAP100Q494V2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CFAP100Q494V2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CFAP100Q494V2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CFAP100Q494V2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CFAP100Q494V2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CFAP100Q494V2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CFAP100Q494V2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CFAP100Q494V2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CFAP100Q494V2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CFAP100Q494V2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CFAP100Q494V2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CFAP100Q494V2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CFAP100Q494V2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CFAP100Q494V2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CFAP100Q494V2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CFAP100Q494V2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CFAP100Q494V2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CFAP100Q494V2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.45
CFAP100Q494V2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CFAP100Q494V2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CFAP100Q494V2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
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