Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
KRTAP25-1Q3LHN0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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KRTAP25-1Q3LHN0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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KRTAP25-1Q3LHN0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP25-1Q3LHN0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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KRTAP25-1Q3LHN0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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