Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CNPY1Q3B7I2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNPY1Q3B7I2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNPY1Q3B7I2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNPY1Q3B7I2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNPY1Q3B7I2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms