Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SKIDA1Q1XH10 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SKIDA1Q1XH10 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SKIDA1Q1XH10 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SKIDA1Q1XH10 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms