Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP6V1FQ16864 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP6V1FQ16864 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6V1FQ16864 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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