Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN21Q16825 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPN21Q16825 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN21Q16825 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN21Q16825 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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