Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACKR1Q16570 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACKR1Q16570 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACKR1Q16570 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACKR1Q16570 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms