Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MRPL23Q16540 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRPL23Q16540 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRPL23Q16540 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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