Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB11BQ15907 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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RAB11BQ15907 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB11BQ15907 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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RAB11BQ15907 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB11BQ15907 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB11BQ15907 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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