Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN9AQ15858 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN9AQ15858 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCN9AQ15858 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCN9AQ15858 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCN9AQ15858 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCN9AQ15858 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SCN9AQ15858 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCN9AQ15858 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCN9AQ15858 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SCN9AQ15858 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCN9AQ15858 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCN9AQ15858 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SCN9AQ15858 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SCN9AQ15858 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SCN9AQ15858 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SCN9AQ15858 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SCN9AQ15858 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SCN9AQ15858 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCN9AQ15858 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
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