Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USF2Q15853 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USF2Q15853 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USF2Q15853 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USF2Q15853 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USF2Q15853 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USF2Q15853 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USF2Q15853 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USF2Q15853 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USF2Q15853 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USF2Q15853 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
USF2Q15853 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USF2Q15853 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USF2Q15853 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
USF2Q15853 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USF2Q15853 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USF2Q15853 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
USF2Q15853 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USF2Q15853 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USF2Q15853 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USF2Q15853 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USF2Q15853 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
USF2Q15853 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USF2Q15853 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USF2Q15853 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
USF2Q15853 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
USF2Q15853 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USF2Q15853 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USF2Q15853 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USF2Q15853 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
USF2Q15853 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USF2Q15853 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
USF2Q15853 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USF2Q15853 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USF2Q15853 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
USF2Q15853 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
USF2Q15853 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
USF2Q15853 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USF2Q15853 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
USF2Q15853 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
USF2Q15853 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USF2Q15853 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USF2Q15853 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
USF2Q15853 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
USF2Q15853 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
USF2Q15853 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
USF2Q15853 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USF2Q15853 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USF2Q15853 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
USF2Q15853 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
USF2Q15853 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
USF2Q15853 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USF2Q15853 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USF2Q15853 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USF2Q15853 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
USF2Q15853 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
USF2Q15853 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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