Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC1Q15751 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HERC1Q15751 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC1Q15751 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HERC1Q15751 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC1Q15751 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC1Q15751 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC1Q15751 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC1Q15751 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC1Q15751 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERC1Q15751 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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