Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HMGN3Q15651 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
HMGN3Q15651 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HMGN3Q15651 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HMGN3Q15651 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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