Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLR1Q15399 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR1Q15399 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR1Q15399 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms