Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCD1Q15116 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD1Q15116 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDCD1Q15116 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PDCD1Q15116 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDCD1Q15116 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCD1Q15116 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCD1Q15116 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCD1Q15116 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCD1Q15116 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCD1Q15116 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCD1Q15116 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCD1Q15116 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCD1Q15116 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDCD1Q15116 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDCD1Q15116 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCD1Q15116 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCD1Q15116 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCD1Q15116 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCD1Q15116 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCD1Q15116 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCD1Q15116 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCD1Q15116 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCD1Q15116 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCD1Q15116 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCD1Q15116 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCD1Q15116 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDCD1Q15116 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDCD1Q15116 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDCD1Q15116 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCD1Q15116 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD1Q15116 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD1Q15116 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCD1Q15116 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCD1Q15116 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCD1Q15116 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCD1Q15116 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCD1Q15116 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms