Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
BECN1Q14457 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BECN1Q14457 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
BECN1Q14457 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BECN1Q14457 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
BECN1Q14457 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
BECN1Q14457 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30■■■□□ 2.39
BECN1Q14457 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
BECN1Q14457 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BECN1Q14457 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
BECN1Q14457 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
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